小米手机开机后发现所有app都没有了，可能是由多种原因导致的，可以尝试以下解决方法：
检查应用是否被卸载：
打开手机设置，进入应用管理，查看消失的软件是否显示下载按钮。如果是，说明软件已被卸载，需要重新安装。
检查应用是否被隐藏：
使用两个手指在桌面下滑（适用于MIUI12以上版本），看是否弹出输入密码的界面。输入密码后，可能能看到隐藏的应用。
或者在设置中找到“隐私保护”，点击“隐藏应用”，查看是否有打勾的应用，取消勾选即可显示在桌面。
检查应用是否被冻结：
进入设置-应用设置-系统管家-应用管理-应用冻结，查看是否有应用被冻结。如有，需要先解冻。
清除系统桌面缓存：
进入设置-应用管理-系统桌面-存储，选择清除缓存。清除后，尝试强制重启桌面并重启手机。
检查存储空间：
打开设置-存储，查看剩余空间。如剩余空间不足，建议删除不用的照片、视频或卸载不常用的应用，确保剩余空间足够后再重启手机。
系统更新：
检查是否有系统更新可用。如有新版本，下载并安装，因为系统版本问题有时也会导致图标显示异常。
第三方软件干扰：
切换回官方默认主题或卸载第三方桌面应用，以排除第三方软件的干扰。
如果以上方法均无效，可以考虑恢复出厂设置，但务必提前备份好数据。如怀疑是硬件问题，如手机最近摔过或进过水，建议前往小米授权服务中心进行检测。