近亲繁殖是指某个个体与其共同祖先有着直接或间接的关系。这种关系可以通过血统图来表示，即某个个体的父母或祖父母以及其他亲属都属于该个体的共同祖先。近亲繁殖的程度可以用“近亲繁殖系数”来计算，该系数最早由美国遗传学家Sewall Wright在20世纪提出，并以符号“F”表示。
具体而言，假设个体A的父亲B和母亲C都属于共同祖先D的直系血亲关系。当D与B、C共有某一个特定基因位点时，该基因位点将从D传递给B，在接下来50%的概率下被传递给A。同时，在D与C共有某一个特定基因位点时，该基因位点将从D传递给C，在接下来50%的概率下被传递给A；因此，在一个特定基因位点上，个体A具有两个拷贝的概率为12.5%。
值得注意的是，虽然D现在是C的祖父而非父亲，但近亲繁殖概率仍然会降低为6.25%，这是因为同一基因位点在C身上被传递的概率较原来的一半。
尽管以上例子比较简单，但在一个封闭的狗群中情况往往会更加复杂。这是因为同一个体可能出现在血统图的两端，并且你往往会有多重的共同祖先。然而，计算近亲繁殖系数所依赖的法则仍然是相同的——每个近亲繁殖可能来源对于整体值具有累计效果。
具体而言，假设个体A的父亲B和母亲C都属于共同祖先D的直系血亲关系。当D与B、C共有某一个特定基因位点时，该基因位点将从D传递给B，在接下来50%的概率下被传递给A。同时，在D与C共有某一个特定基因位点时，该基因位点将从D传递给C，在接下来50%的概率下被传递给A；因此，在一个特定基因位点上，个体A具有两个拷贝的概率为12.5%。
值得注意的是，虽然D现在是C的祖父而非父亲，但近亲繁殖概率仍然会降低为6.25%，这是因为同一基因位点在C身上被传递的概率较原来的一半。
尽管以上例子比较简单，但在一个封闭的狗群中情况往往会更加复杂。这是因为同一个体可能出现在血统图的两端，并且你往往会有多重的共同祖先。然而，计算近亲繁殖系数所依赖的法则仍然是相同的——每个近亲繁殖可能来源对于整体值具有累计效果。