根据题意得：AC=CD，∠ABD=90°．
在直角三角形ABD中，
∵AB=3000，AD=5000，
∴BD=AD2-AB2=4000
设CD=x米，则AC=x米，BC=4000-x（米），
在Rt△ABC中，AC2=BC2+AB2，
即x2=30002+（4000-x）2
解得：x=3125，
答：该店与车站D的距离是3125米
在直角三角形ABD中，
∵AB=3000，AD=5000，
∴BD=AD2-AB2=4000
设CD=x米，则AC=x米，BC=4000-x（米），
在Rt△ABC中，AC2=BC2+AB2，
即x2=30002+（4000-x）2
解得：x=3125，
答：该店与车站D的距离是3125米