红米Note13Pro+的智能断充保护功能失灵，可以尝试以下方法：1、重新启动手机：有时候智能断充保护功能会因为系统问题而失灵，重新启动手机可以尝试解决这个问题。2、检查充电线和充电器：检查充电线和充电器是否正常工作，如果发现有问题，可以尝试更换新的充电线和充电器。3、检查电池和充电口：电池和充电口会因为长时间使用或不当使用而受损，需要检查是否有损坏或污垢。4、更新系统：如果手机系统版本过低，会影响智能断充保护功能的效果，可以尝试更新系统到最新版本。
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我觉得你这个情况有可能是系统缓存出问题了，我之前手机各种小毛病都是靠清除缓存解决的，尤其是电池相关的功能容易受缓存影响，你可以进recovery模式清除一下系统缓存分区，不用刷机也不丢数据，操作也简单，长按电源键和音量上键就行，清完之后重启手机，再看看智能断充能不能正常启用，我当时就是这么弄好的，比跑售后快多了
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其实吧，有时候这功能失灵可能只是显示有问题，我查过资料，小米的智能断充是靠算法预估电量来控制的，并不是真正充满100%才断，有时候系统判断你即将拔掉充电器就会提前停止涓流充电，看起来像坏了，其实是为了延长电池寿命，你可以观察一晚上，看是否真的持续充电不中断，如果确实一直冲到发烫那才真有问题，不然可能只是正常机制
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我之前也遇到过类似的情况，红米note13pro+的智能断充保护突然就不工作了，一开始我还以为是充电器的问题，换了好几个原装和第三方的充电头都没用，后来发现其实是系统更新后有个小bug导致的，我直接去设置里把省电模式关掉再重新开启，顺便重启了一下手机，结果功能就恢复正常了，建议你先试试重启或者检查有没有系统更新没装
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这个问题我也碰到过，当时特别担心电池会鼓包，毕竟一直充电不自动停挺危险的，后来我去小米社区看了下，好多人反馈说可能是后台某些应用在后台偷偷唤醒导致系统误判充电状态，我就把那些耗电高的app都限制了后台活动，还清空了电池优化里的白名单，然后重新设置了智能断充，之后就好了，你可以去电池管理里看看有没有异常耗电的应用